目前对于肿瘤进化主要遵循克隆进化和/或选择框架模型进行研究。这种肿瘤进化模型中,线性进化描述了由于连续获得赋予生长和/或存活优势的突变而产生的进化,其中顺序克隆包含这些有利的突变,对比祖先克隆更具优势。分支进化显示出现不同增殖的多个亚克隆肿瘤细胞群体存在共同祖先。分枝进化使产生更多异质性肿瘤的可能性大大增加[37-39],如同一EGFR突变的非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)肿瘤经TKI治疗,可出现不同的耐药克隆[34]。许多实体肿瘤采用分支的进化模式,而某些血液系统恶性肿瘤的系统发育则采用线性模式[38-43]。不过,一些研究对克隆亚群必须始终处于竞争中的假设提出质疑,这些研究结果显示,在非细胞自主启动的癌症中,不同亚克隆共同促进肿瘤细胞增殖[44-46]。此外,干细胞学说研究发现,肿瘤干细胞在克隆进化过程中存在不同模式,某些肿瘤干细胞在克隆进化的过程中发生突变,增加肿瘤异质性;某些肿瘤干细胞再分化为非肿瘤干细胞的过程中发生突变,增加异质性;还有些肿瘤干细胞发生突变,在随后的进化和分化过程中产生异质性。因此不同的肿瘤干细胞模式对肿瘤耐药及疾病进展可产生不同影响[47]。. Here, EGFR is linked to non-small cell lung carcinoma.