几个已知或推定的肿瘤抑制基因的异常甲基化频繁发生于肺癌的生成。APC、p16、RASSF1A(RAS association domain family 1)、CDH13、RARβ、MGMT、GSTP1是经常在肺癌中被甲基化的基因。Toyooka等[13]在115例NSCLC中检测上述基因的甲基化状态,发现p16的异常甲基化较常见于SQCC,而APC和CDH13甲基化在ADC中高于SQCC。随后,Toyooka等[14]收集了来自美国、澳大利亚、日本和台湾的514例NSCLC组织及84例相应的非肿瘤肺组织,进一步检测显示,ADC中APC、CDH13、和RARβ的甲基化率高于SQCC。近期Lockwood等[2]发现ADC和SQCC的总体甲基化水平无明显不同,但在DNA甲基化上两种亚型之间确实有基因特异性差异,约发现2, 384个基因的甲基化程度不同。与ADC组相比,SQCC组有明显较多的频发高甲基化和低甲基化基因位点,约占92%。. This evidence concerns the gene MGMT and AIDS dementia complex.