肿瘤生物标记物的另一重要方面是它们为选择更具靶向性的治疗方法提供了预测价值。蛋白质组学分析显示,14-3-3σ和maspin的下调,以及GRP78和Mn-SOD的上调,均与NPC的放疗耐受显著相关。在识别放疗耐受的NPC患者的放疗敏感度中,四种蛋白联合应用的敏感性和特异性分别为90%和80%。而且,放疗耐受细胞通过过表达14-3-3σ可部分逆转对电离辐射的耐受[20]。治疗前活检标本的蛋白质组学和免疫组织化学分析显示,对新辅助放疗或紫杉醇治疗呈现病理完全缓解的乳腺癌患者的免疫信号分子α-defensin呈过表达。对术前接受基于紫杉醇治疗的肿瘤患者的大样本分析显示,手术时的α-defensins与治疗效果相关[21]。. This evidence concerns the gene SERPINB5 and nasopharyngeal carcinoma.