KIR与HLA基因(或特定的等位基因)的特定组合的联合遗传与对疾病的易感性相关,这提示多种可能的影响机理[31, 43, 96]。许多研究发现,抑制性较弱的KIR/HLA复合基因型(如低亲和力KIR2DL3纯合子与同源性HLA-C1配体)与对炎症性疾病的易感性呈正相关。这些研究提示,活化阈值较低(由于抑制作用较弱)导致NK细胞和T细胞的过度反应,这可能会促使免疫系统过度激活。与之相对,已有研究显示抑制性较弱的KIR/HLA复合基因型对某些病毒感染具有保护作用。这些资料提示,NK细胞和溶细胞性T细胞的抑制性KIR间的相互作用越弱,感染清除能力越强。然而,Carrington实验室发现激活性KIR3DS1/Bw4和抑制性KIR3DL1/Bw4的受体/配体组合均对HIV/AIDS具有保护作用(衡量标准为AIDS的进展率和病毒的负荷量)[104],说明KIR/HLA组合对免疫应答反应有多重影响,在进一步了解其机制之前,上述结果难以解释。. Here, KIR3DL1 is linked to AIDS.